刀と銃と暴力が横行する無秩序きわまりない世界に、復讐を誓った一人の侍がいた。 彼の名前はアフロ、額に巻かれたハチマキには「二番」の文字が刻まれている。 この世界では、二番を持つ者だけが、一番ハチマキを持つもの、すなわち世界一の剣客（＝神）と戦えるという掟があり、二番強奪を企む輩にアフロは常に命を狙われる。 そして彼もまた、幼い頃父親を殺した一番ハチマキの持ち主を目指して旅をする、一人の剣客であった。ロケット弾を放つ「六太郎」、アフロの剣術データをメモリしたロボット「アフロドロイド」、アフロの昔なじみらしいかぶりものの「クマ侍」等等、無無坊主が次々と送り込む剣客の数々に、果敢に挑むアフロサムライ。
彼ははたして、父親の復讐を果たすことが出来るのだろうか？

ある日、西は電車内に飛び込んできた初恋の相手・みょんと再会を果たす。彼女の案内で姉・ヤンの経営する焼き鳥屋に案内されたが、そこで彼女がりょうと婚約している事を知り、落ち込む。その時、突如借金取りのヤクザが押しかけ、それに巻き込まれた西は、お尻の穴から銃弾を撃たれて脳天破裂という、何とも無様な形で死んでしまった。しかし、現世に未練残りの西は、神様の意志に逆らい、自らの意思で生還したのであった。

時に寛永十五年、徳川幕府のキリスト教弾圧に端を発した島原の乱は、キリシタ 　ン軍一万八千人と若き総大将・天草四郎時貞の壮絶なる死をもってその幕を閉じ 　た。しかしそれは、これから始まろうとする戦いのほんの幕開けにすぎなかった 　・・・。　四郎の腹心・森宗意軒は邪悪な黒魔術・魔界転生により四郎を復習の 　鬼サタンとして、そして今は無き名大の剣豪達を殺戮の亡者として現世に甦らせ、 　巨大な権力徳川幕府へと戦いをいどんだ。　迎え撃つは柳生十兵衛光巌率いる公 　儀隠密衆。

ルフィたちのゴーイング・メリー号は、アラバスタ王国に向かってグランドラインを突き進んでいた。砂漠の国と呼ばれるアラバスタは、悪の秘密結社の暗躍により、崩壊の危機に直面していた。王女・ビビは組織の正体を暴くために国を出奔、やがて諸悪の根源が王国の英雄・クロコダイルにあることを知る。ルフィをはじめとする心強い仲間を得たビビは、父王と国民を救うため、故国・アラバスタに戻るのだが…。

その夏の終わりは、少女たちの飛び降り自殺が相次いだ。突発的に廃墟と化したビルの屋上から空へと踊る。そして落下、待っているのは死。一切の関連性と自殺の理由を見出せぬまま、不可解な自殺事件として報道されるなか、唯一、その関連を見出したものがいた。最高位の人形師で魔法使いになれなかった魔術師の蒼崎橙子である。むしろ「理由がない」ことが共通点だと。そして、浮遊と飛行の差異。この連続自殺事件の捜索に乗り出したのは、万物の生の綻びこと死線を視る力“直死の魔眼”を持つ両儀式。望まぬまま得た力により、虚空に舞う少女たちの幽霊をその瞳に捕らえる式は果たして何を思うのか。